Mnoga oboljenja iz različitih medicinskih domena mogu da se leče homeopatski. Na prvom mestu to su psihosomatska oboljenja (psihosomatsko oboljenje: oboljenje koje je prouzrokovano prevashodno psihičkim poremećajima koji su se odrazili na funkcionisanje organa sa mogućnošću kasnijeg organskog oštećenja) kod kojih konvencionalna terapija često ima ograničen efekat a pacijentu (i lekaru) predstavljaju veliki problem. Takođe, mnoga oboljenja organa za disanje, organa za varenje, reumatska oboljenja, kardiovaskularna (ugl. oboljenja iz svih grana interne medicine),određene kožne promene, razna urološka i ginekološka oboljenja, oboljenja iz neurološkog i određena oboljenja iz psihijatrijskog domena itd.
Preuzimanje slučaja i izbor metode lečenja određuje lekar homeopata uzimajući u obzir sve relevantne činjenice u cilju predlaganja najadekvatnijeg tretmana koji je neophodan pacijentu u datom trenutku.